以柯南为首的少年侦探团自事件发生之后，也按照自己的方式进行调查。柯南的切入点自然是从心之怪盗团彻底消失的谜团开始调查起。当初，根本没有公开过，心之怪盗团是如何作案，如何让他人悔过自新，虽然有陈述过这是一种异能，但是问题是，到现在也没有官方的答案。
于是柯南还专门去找过雨宫莲询问情况。
雨宫莲似乎已经被人找过一次了，又或者是因为他原本就预料到会有相关的问话，他的回答有条不紊，没有逻辑漏洞。在提及当初狮童正义出事的时候，他也有不在场证明，同时他也说，绫小路能证明这一点。
“也就是说，绫小路一直都是和你在一起，他也有不在场证明。“
雨宫莲没有直接回话，而是说道：“你好像一名侦探。“
“我确实是一名侦探。”
“所以，你其实怀疑过我，或者绫小路？“
当时整个事件里面牵扯最深的唯二留下来的两个人便是雨宫莲和绫小路清隆。一个是心之怪盗团的团长，另外一个是站在对立面的明智吾郎的助手。
雨宫莲这话一落，柯南下意识地一惊。他全程没有提到过绫小路，但他确实怀疑过绫小路的事情。
他从前听过绫小路曾经这样说过雨宫莲，他是一个聪明的人。在这聪明的基础上，他更是一个善良并愿意相信其他人的人。正因为他这份善良与热忱，有时候也会掩盖掉他能看透人心的能力，他只是想去相信，而并非只是一个只会完全相信别人的说辞，自己无法思考的人。
既然雨宫莲已经说开了，柯南也不必遮遮掩掩的。
“我确实怀疑绫小路在整个事件里面扮演的角色，但是我的这些行动并不是试图要去证明他是有罪的。恰恰相反，绫小路是我的朋友。我是为了证明他的清白而来的。”
除此之外，他觉得绫小路并不在东京咒高。
一种强烈的直觉告诉他，绫小路与这些事情牵扯并不浅。只是这些事情，到底会涉及多少柯南常识无法理解的领域，就成了他推理的阻碍。
柯南的回答让雨宫莲有些诧异：“你不会觉得绫小路杀人吗？”
“因为我认识的绫小路是个认真生活的人。哪怕他失忆过，或者身上还背负着什么秘密，但他依旧是一个朝着阳光不断前进的人。我不认为他会被复仇之类的情绪迷住眼睛。”
柯南也觉得绫小路不像是那种为了复仇殚精竭虑，辛苦经营的人。
“……”
柯南不知道为什么雨宫莲突然不说话，但是他脸上确实浮现了一种名为羞愧的情绪。柯南若是有读心术，恐怕就会知道雨宫莲之所以会露出这样的表情，就是因为当初他怀疑过绫小路操纵了一切，才单方面断绝了与他的联系。
在柯南离开的时候，他收到了来自雨宫莲这么一段话。
“其实那天我并没有见到绫小路，只通过电话，绫小路给我留了一张纸。那是药店的发/票，上面修正后的地址是狮童正义案发时附近的药店地址。我并不认为这是直接证据，但是这已经是强而有力的间接证据，说明他也有可能是嫌疑人。”
雨宫莲原本想要为绫小路消除这个不小心犯下的失误，但他舍不得上面的留言，又一直放在御守里面等着。他没有回老家，依旧待在东京，也是为了等绫小路给他一个最后的答案。
“那发/票呢？”
“我遇到一位名为太宰的先生，他和我保证，不会伤害绫小路后，我把纸给他了。”雨宫莲希望太宰治能保护绫小路，毕竟两个人是恋人关系。
“那应该是武装侦探社的侦探了。”
柯南见过太宰治。
“……”
柯南对此很可惜：“看来我能查到的地方已经有限了。武装侦探社的侦探们行动比我想象中的还要更快。在事情发生之前，就已经开始着手调查了。”说完之后，他还朝雨宫莲道了歉，给他添麻烦了。
但雨宫莲说道：“如果绫小路是真的犯罪嫌疑人的话，那其实是值得庆幸的吗？”
“怎么说？”柯南一时间脑筋转不过弯。
“也许狮童正义和明智吾郎并没有死。”
柯南瞬间睁大了眼睛。
……
于是，柯南也成了观望的一方，在电视机前开始看新闻的发展。阿笠博士见他一开始还天天往外跑，但见了雨宫莲之后，他却能忍住自己的侦探瘾坐在家里面，真的是太难得了。
新闻今天听说会宣布狮童正义案的嫌疑犯。
柯南考虑到若是绫小路的话，考虑到对未成年人的保护，可能会用假名，并在眼睛部分打了码。他才那么想，新闻上就出现了嫌疑人的照片——上面写着「森鸥外」，横滨港口区黑手党首领。