达赖喇嘛是格鲁派中最重要的活佛转世系统之一。
“达赖喇嘛”一词中“达赖”是蒙古语，意为海，“喇嘛”是藏语，意为上师。
这一名称最初由明代蒙古土默特部首领俺答汗赠给格鲁派高僧索南嘉措，称其为“圣识一切瓦齐尔达喇达赖喇嘛”。
而早在明朝永乐七年的时候，宗喀巴倡导宗教改革，创立格鲁派，逐步发展成为藏传佛教影响最大的教派。
而嘉靖二十一年的时候，是漫天神佛乱飞的年代，因为嘉靖帝是一个信仰鬼神的皇帝，当年拉萨哲蚌寺法台、格鲁派重要领袖根敦嘉措圆寂，寺院认定今西藏拉萨市堆龙德庆县的一名幼童为其转世灵童，经报请当时西藏第司地方政权同意后，于嘉靖二十六年被迎往哲蚌寺坐床，取法名索南嘉措，时称哲蚌寺活佛。
当时明朝跟蒙古的关系一直很紧张，蒙古人贼心不死，明朝对一切非汉族的人都保持着一定的警惕，以至于明朝那个时候对蒙古的各种佛教信仰是一点都不了解。
明神宗万历六年，应蒙古土默特部首领俺答汗（明朝封“顺义王”）之请，索南嘉措前往青海相会。俺答汗称索南嘉措为“圣识一切瓦齐尔达喇达赖喇嘛”（指在显宗和密宗两方面都获得最高成就、学识渊博犹如大海一样的上师），从此开始有达赖喇嘛称号。
索南嘉措被认为是第三世达赖喇嘛，追认根敦朱巴为第一世达赖喇嘛、根敦嘉措为第二世达赖喇嘛。
一直到万历十五年，明朝中央政府封索南嘉措为“朵儿只唱”（意为“金刚持”），赐印，准许进贡，这是达赖喇嘛世系首次受到中原朝廷的封赏。
但是也就只有这么一次封赏的记载。
一直到清朝的顺治九年，第五世达赖喇嘛·阿旺洛桑嘉措率众自西藏起程，前往北京朝觐。
次年，也就是顺治十年一月抵京，顺治皇帝会见，待以殊礼，在拉萨布达拉宫内保存完整的顺治皇帝接见五世达赖喇嘛壁画，生动记载了这一重大历史事件。
并且顺治皇帝为此特别修建了一座庙宇给这位达赖喇嘛居住。
顺治十一年的时候，五世达赖喇嘛请辞获准离京，行至代噶（今内蒙古岱海）时，顺治帝派出礼部尚书罗郎丘、理藩院侍郎席达礼等官员，携带满、蒙、藏、汉四体文字的金册、金印前往，册封五世达赖喇嘛为“西天大善自在佛所领天下释教普通瓦赤喇怛喇达赖喇嘛”，正式确立了达赖喇嘛的宗教地位和名号。
此后，达赖喇嘛须经大清朝廷的册封，启用印信，成为历史定制。
而因为达赖喇嘛是有册封的，在清朝初期的时候，西藏也不平稳，故而达赖喇嘛是有政权的人，他可以册封噶伦。
噶伦不是僧侣的职位，而是官名。
藏语音译，亦作“噶布伦”、“噶卜伦”。
按照大清对西藏那边的规定：员四人，三品，为主持“噶厦”之官，总办西藏行政事务，受驻藏大臣及达赖喇嘛管辖。
噶伦是原西藏地方政府噶厦的高级行政官员，通常为“三僧三俗”六人。其全称为“噶贡论”，又译为噶布伦，噶卜伦，噶隆，亦称“萨旺”或是“协摆”，藏文本意为国师、大臣、宰辅。恰白·次旦平措认为这一名称最早出现在七八百年前，也可能松赞干布时期已有。
九大臣中名列前三名的人与外戚首领国政最高权力机构，称为“四大尚论”。
“四大尚论制”传至达赖喇嘛，改为“四大噶伦制”保存下来。第巴桑结嘉措新设官职中有噶伦官职，拉藏汗时期也有噶伦官职，但不是最高行政长官。
可是现在，策妄阿拉布坦就因为不想被达赖喇嘛册封的噶伦夺权，就开始了反叛。
其实无非是“权势”二字而已。
“就是，达赖喇嘛要是那么容易被打败，早就在高原上没有立足之地了，何况，策妄阿拉布坦也不是什么好东西。”十四爷道：“虽然他曾经帮咱们抵抗过沙俄，但是也没少捞好处。”
策妄阿拉布坦是准噶尔汗国原首领僧格之长子。
僧格于康熙九年的时候被暗杀后，其弟噶尔丹自西藏返回，在达赖喇嘛以及和硕特首领鄂齐尔图车臣汗的支持下登上了准噶尔大汗之位，策妄阿拉布坦遂率部众依附噶尔丹。
噶尔丹大家都知道的，康熙亲征了三次，这家伙才自己喝药死了。
不过在噶尔丹出兵喀尔喀蒙古的时候，策妄阿拉布坦趁此机会发兵占领了原准噶尔领土，将噶尔丹遏制在科布多无法西还。
此后，策妄阿拉布坦与康熙皇帝合作，彻底击败噶尔丹。