比起上一次世界大战导致的世界毁灭速度更快，这一次只用了两年多一点，世界就再次毁于核弹爆发。
世界的二次毁灭让Zero陷入了不知所措和茫然之中，比起上一次，这一次他仅仅只掌握了了一些基础的外星语言，比如日期什么的，就什么收获都没有了。
这一发现让他对自己产生了强烈的挫败感和自我怀疑，他不会就是传说中的废物吧？明明都穿越回到了过去，他却什么都没能改变，甚至连这一切到底是怎么发生的都不知道！
难道他只能不断地回到过去，然后借着这台时间机器苟且下去吗？
就在他烦躁不堪的时候，他偶然听到了暴露了身份的前同僚在抱怨，明明回来的人还有一些去了政府当高官，为什么还会变成现在这样？
当时的这句话并没有被Zero放在心上，他只是再次如同之前那样协助着穿越了时间，然而一次又一次的回到过去让他发现世界的走向似乎永远都只会走向毁灭，无论他做什么，无论他怎么做，都无济于事。
更糟糕的是，他发现哪怕同样是穿越时间，有的人穿越次数多了之后甚至会发生就此消失的情况。
不是单纯的失去记忆之类的，而是完全消失在这个世界上，回到过去之后，这个世界上就像是从来没有这个人存在一样。
更怪异的是，只有Zero发现了这一点，就连在同样为时间穿越者的其他人里都没有人察觉到不对之处。
Zero感到了无比的恐慌，唯一能做的，就是在这段时间里拼命地学习，不断地研究，反复轮回了五十多次，前前后后花了快一百年，他终于搞懂了这台机器的运作原理和制造方法。
而彼时，科考队本来的成员已经只剩下他一个人了。
而随着Zero学会的东西越来越多，他开始逐渐知道一些以前不明白的事情了，为了探究这一点，他在可以自己制造时光机之后就选择拒绝参加前往木卫五的科研工作，而是想办法进入了本国的政界。
然后他知道了以前他一直都不清楚的事情，世界大战爆发和加速的理由。
Zero之前一直以为他们那批人才是第一批进行时间跳跃的，然而并非如此，在他们之前还有一批人也参与了时间跳跃，那就是最初发现那台时光机器的人。
最初的发现者因为出现了时间跳跃者，而被误以为是科研人员集体失踪事件，导致当时的案卷整个被封存了起来，除了发现第三类接触的事情之外，什么消息都没有对外公布。而第一批跳跃者里，有一个人和他一样，有着不会受到时间跳跃的影响而存在的人，并且那个人还带走了那个地方唯一的一个便携式时间跳跃装置。
那个人告诉了他一件令人绝望的事情，世界大战是很久以前就有预谋而存在的事情，他在第一次时间跳跃之后，就意外发现了这个事情，他不断地尝试去改变，然而更让他绝望的是，每次当他做出行动，世界就会加快毁灭的速度。五十多次下来，世界因为核大战、不明病毒肆虐、怪异气候变化等等各种各样莫名其妙的原因毁灭很多次了。
这一点其实Zero也有所察觉，很多时候，世界的毁灭简直像是固定事项一样，不管这么做，最后似乎都只会引导向世界毁灭这唯一的一个结局。
Zero甚至还亲眼见到过毫无道理可言的天降陨石，说真的，那一次让他简直怀疑人生。
最后那个先行者通过研究得知了世界线理论，并从世界线理论里推算出了一个结论，那就是如今世界线的变动率太低了，只有发生超过阈值的世界线变动，世界才有可能从毁灭的深渊里走出来，不然的话，无论他们做什么，世界都必然会走入毁灭这个结果。而他们这些回到过去的人，将会造成世界毁灭的加速。
先行者万万没想到居然会是这样子的结果，如果什么都不做，世界一定会毁灭，而如果返回过去尝试去改变这一点，世界反而会加速毁灭。
这样子的结论，让先行者觉得尝试跳跃到更久远的时间，久远到他甚至都没有出生的时代，尝试进行变化。
他不清楚自己能不能活得下来，也不清楚这样做会产生什么样糟糕的后果，但是为了阻止世界毁灭，他无论如何都想试一下。
先行者告诉他，他和自己都是被时间锁眷顾的人，所以不会在一次又一次的时间旅行中消失，但是为此，他们会遭到时间的厌弃，成为时间的幽灵，最后被时间的怪物抹杀殆尽。
据先行者所说，他得到的那个机器里记录的外星人就是如此灭绝的。
这一次先行者的时间跳跃就发生在Zero的面前，世界出现了前所未有的巨大变化，世界进入了从未有过的巨大变化，最为明显的一点就是，世界被统一了，被一个名为时之政府的存在以□□的形式统治着。